RIPLRT InstituteInvestigación respiratoria e inmunológica

Investigación

Los enfoques científicos que usamos para cumplir nuestra visión y misión.

Ciencia de exposiciones

Como señalan las Academias Nacionales de Ciencias de EE. UU. en Exposure Science in the 21st Century: A Vision and a Strategy, la ciencia de exposiciones vincula (a) el origen de un contaminante y su concentración desde una fuente dada, (b) la conducta humana durante o como resultado de la exposición, (c) la interacción entre el contaminante y el sujeto humano, y (d) el desenlace de esa interacción. Según la pregunta y el proyecto — a menudo colaborativo — abordamos dos o más de estos componentes.

Inmunotoxicología basada en humanos

Para alinear los perfiles de biomarcadores con la exposición a contaminantes ambientales, empleamos enfoques inmunológicos basados en humanos. Nuestro investigador principal tiene una larga trayectoria ampliando la utilidad de los ensayos inmunológicos hacia nuevas áreas de investigación, reconocida entre otros por el premio Lush Prize Young Researcher.

Ciencia de datos computacional y gestión de datos

Es un problema para la ciencia cuando hay hallazgos relevantes pero los enfoques estadísticos no son reproducibles. En RIPLRT usamos R, Python y MATLAB para mantener nuestra ciencia de datos reproducible. Publicamos los scripts de análisis, y con frecuencia los datos crudos, en repositorios abiertos como GitHub, el Open Science Framework, FigShare y Zenodo.

Los métodos han evolucionado de las pipetas a los flujos de trabajo computacionales. RIPLRT comenzó en 2018 como un grupo de inmunología de laboratorio húmedo; desde 2021 su centro de gravedad se ha desplazado hacia un modelo híbrido computacional y traslacional que combina el trabajo molecular con el descubrimiento basado en repositorios y el pronóstico a nivel poblacional. La misión — entender los determinantes ambientales de la salud respiratoria e inmunológica y traducir ese entendimiento en equidad — ha sido la constante desde el primer día.

Dónde vive la ciencia

Datos y métodos

Nuestro ciclo de implementación a corto plazo enfatiza la validación computacional y en el mundo real usando repositorios existentes de vigilancia, atención médica y biomarcadores, junto con nuevo trabajo de laboratorio — todo dentro de un marco de reproducibilidad y análisis estratificado por equidad.

Datos de vigilancia y reclamaciones

  • Vigilancia de esporas fúngicas y virus respiratorios en Puerto Rico
  • Datos de reclamaciones y farmacia del Departamento de Salud de Puerto Rico / ASES
  • Meteorología y flujos de exposición de dispositivos portátiles

Métodos analíticos

  • IA/aprendizaje automático con explicabilidad SHAP
  • Modelos de rezago distribuido y de efectos mixtos
  • GWAS y puntuaciones de riesgo poligénico
  • Análisis de mediación causal
  • Arquitecturas de IA multiagente
  • Métricas de desempeño conscientes de la equidad

El detalle completo de nuestra identidad científica, recursos de datos y estándares de reproducibilidad está en el Manual del grupo de investigación del RIPLRT Institute (en inglés).

Temas activos

Dónde se concentran nuestros proyectos

Ambientes interiores tras desastres

Amplificación fúngica en interiores y potencial proinflamatorio del polvo sedimentado en viviendas con daños por agua durante el huracán María en Puerto Rico.

Aeroalérgenos y desenlaces respiratorios

Esporas fúngicas y polen ambientales como predictores del uso de servicios de salud por asma y de la incidencia de virus respiratorios, usando modelos de series de tiempo y aprendizaje automático.

Microbioma y salud respiratoria

Perfiles del microbioma nasal y salival en infantes y adultos, incluidos métodos de recolección no invasivos desarrollados con nuestros colaboradores.